Patsiendid, kellel ei olnud sündmust, tsenseeriti viimasel jälgimispäeval või pärast 10 aastat kliinilistest andmetest. Kõrva onkoloogia ravimisel peetakse seda peamiseks terapeutiliseks meetodiks, kuna see aitab kaasa kasvaja inhibeerimisele ja kasvaja protsessi edasisele arengule. Võimalik idaneda kõhre kude, samuti metastaseeruda kõrvakanalisse. Elektrooniline täiendav materjal Täiendavad andmed Märkused Kommentaari esitamisega nõustute järgima meie tingimusi ja ühenduse suuniseid.
Siiski, ei uuritud, kas nende kasvaja supresseerivate miRNA-de ekspressioonid muutuvad patsiendi ellujäämiseks suurte kohortidega.
Kuslapuu sortide kirjeldus
MiRa või miRc kõrge ekspressioon oli seotud oluliselt parema üldise elulemusega OS. Geenikomplekti rikastamise analüüs GSEA näitas, et miRa madalatel ekspressioonitasemel oli kalduvus seostuda EMT geeni rikastamisega, samas kui miRc ei olnud TCGA kohordis ja meie tulemused toetavad valideerimise vajadust suure kohordi järgi kasutada miRNA-d rinnavähiga patsientide prognostilise biomarkerina. Sissejuhatus Rakubioloogia keskne dogma näitab, et geneetiline informatsioon voolab ühesuunaliselt DNA-st messenger-RNA-le mRNA ja seejärel valgule, mis määrab raku funktsiooni ja käitumise.
Viimasel kümnendil on ncRNAd kogunud Hurt spin onkoloogia tunnustust nende oluliste rollide eest erinevate bioloogiliste protsesside reguleerimisel 1, 2, 3, 4, 5, 6. Sellest ajast alates on miRNA-uuringud kiiresti laienenud ning avastatud on mitmeid olulisi miRNA funktsioone rakusiseses või rakuvälises regulatsioonis.
Nüüd on teada, et miRNA-del on kaks peamist transkriptsioonijärgset epigenoomilist regulatiivset funktsiooni: 1 mRNA translatsiooniline represseerimine ja 2 mRNA lõhustamine 9. MiR ja miR ekspressioonid pärssisid kroonilise lümfotsüütilise leukeemia patsientide proovides ja rakuliinides, mis viis tuumori supresseerivate miRNAde avastamiseni Rinnanäärmevähi puhul Iorio et al.
MiRNA-de rolli rinnanäärmevähi bioloogias on pidevalt uuritud 13, 14, On näidatud, et onkogeensed miRNA-d inhibeerivad tuumori supresseerivaid geene või aktiveerivad mõningaid onkogeenseid radu, kusjuures supressiivsed miRNA-d inhibeerivad posttranslatsioonilise modifikatsiooni 9, 16, 17 kaudu onkogeense geeni funktsiooni. Sihtgeen ei ole ühekordne kirjavahetus. Teisisõnu, üks miRNA sihib mitmeid geene või radasid post-translatsiooniliste mehhanismide kaudu. Nii in vivo kui ka in vitro on selgelt näidatud, et kasvaja supresseeriva miRNA madal tase on seotud vähi agressiivsusega, nagu vähi proliferatsioon või kasvaja metastaas, ning kasvaja supresseeriva miRNA kõrge tase inhibeerib vähi kasvu Paljusid neist aruannetest ei ole siiski kinnitatud suurtes rühmades, mis piiravad nende uuringute statistilist jõudu.
Näiteks Tavazoie et al. Siiski oli selles analüüsis patsientide arv ainult Hiljuti demonstreeriti, et ka miRc-l on kasvaja supresseeriv funktsioon rinnavähi epiteel-mesenhümaalse ülemineku EMT kaudu. Song et al.
Cancer Genome Atlas TCGA on National Cancer Institute'i National Cancer Institute, NCI ja Riikliku Terviseinstituudi Riikliku Inimese Genoomiuuringute Instituudi ühine koostöö, mis on kogunud ravimata varem esinenud vähi proovid enam kui 10 patsiendilt üle 30 kasvaja tüübi ja pakub genoomseid ja Hurt spin onkoloogia andmeid, mis saadakse suure läbilaskvusega sekveneerimismeetoditega Ligikaudu rinnavähi proovi koguti TCGA kohortis 18, mis võimaldab uurijatel kasutada suuri proovikoguseid ja seega on neil piisav statistiline võimsus analüüsiks.
Näiteks on meie grupp hiljuti näidanud, et halva prognoosiga seotud angiopoetiinirada, kasutades TCGA-d kui representatiivset andmebaasi, mis pakub mRNA ekspressiooniandmeid ja ellujäämise tulemusi rinnavähis Kuigi on teatatud mitmetest aruannetest, mis näitavad, et mõnel miRNA-l on rinnavähi korral kasvaja supresseeriv funktsioon, jääb nende üldine kliiniline tähtsus ebaselgeks, sest nende toimet on uuritud ainult väikestes rühmades.
Tulemused Kirjanduse otsing Hurt spin onkoloogia supresseerivate miRNA-de tuvastamiseks rinnavähis Oleme läbi viinud kirjanduse otsingu PubMed Central'i abil, et tuvastada kasvaja supresseerivaid miRNA-sid rinnavähi korral.
Me tuvastasime mitmed tuumori supresseerivad miRNA-d, mida on teatanud mitu rühma, kuid millel puudub piisavalt suur kohordi valideerimine. Meie analüüsiks valisime 9 miRNA-d: miRa, miRc, miR, miR, miR, miRb, miRc, miR ja miR, mis on teatatud olema rinnavähi kasvaja supresseerivad miRNA-d tabel 1 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, Täissuuruses tabel Lühidalt öeldakse, et miRa ja miRc inhibeerivad rakkude migratsiooni ja invasiooni sihtmärgiks oleva vimentiini või teiste epiteelse mesenhümaalse ülemineku EMT -molekulide nagu Slug või TWIF1 20, 23, 27 kaudu.
MiRa reguleerib ka UBE3C, ubikvitiini valgu ligaasi perekonda, mille tulemuseks on rakkude proliferatsiooni ja migratsiooni pärssimine MiR ja miR on tuumori supresseerivad miRNA-d, mis vähendavad luu- või kopsu-metastaase, kasutades rakupõhist põhjalikku miRNA mikroarray analüüsi inimese rinnavähis MiR pärsib ka metastaase ja rännet progenitorrakkude transkriptsioonifaktori SOX4 ja ekstratsellulaarse maatriksi komponendi tenascin C TNC 34 suunamise kaudu.
Märksõna: Isikud | ERR | Digihoidla
FOXP3-miR perekonna-NF-kB telg võimaldab tuumori supresseerivat funktsiooni, nagu rakkude kasvu või kasvaja metastaaside inhibeerimine in vitro või in vivo testis On teatatud, et MiRc näitab mitut tahket tuumorit, sealhulgas rinnavähki, tuumori supresseerivat funktsiooni Ootamatult ei näidanud miR, miRb ja miRc olulisi erinevusi joonis 1. Huvitav on see, et miRc näitas vähi kudedes kõrgemaid ekspressioonitasemeid kui normaalsetes kudedes, mis oli eelmiste aruannete vastupidine suundumus joonis 1.
- Kuidas eemaldada kasvaja kaega, kui liigese poletik
- Kuslapuu sortide kirjeldus - Vitamiinid April
- Kui kuslapuu on otse põõsast, siis ei saa te seda pesta.
- Verejooksud, polüübid või haavandid; Lümfisõlmede turse.
Täissuuruses pilt Tuumori supresseeriva miRNA ekspressiooni prognoosiline tähtsus rinnavähiga patsientidel Selleks, et määrata 9 kasvaja supresseeriva miRNA-i prognoosiline tähtsus rinnavähi korral, analüüsiti OS-i, kasutades iga MiRNA kõrge ja madala ekspressioonirühma vahel Kaplan-Meieri kõveraid ja logaritmi testi.
OS-i võrreldi Kaplan-Meieri kõverate ja logaritmi aatri testiga kõrge Hurt spin onkoloogia jooni ja madala sinine joon ekspressioonigruppide vahel, mis määrati iga miRNA-spetsiifilise lävega.
Märksõna: Isikud
P väärtus rasvases kirjas näitab statistilist olulisust. Täissuuruses pilt 9 kasvaja supresseeriva miRNA ekspressiooni rinnavähis uuriti nende mõju suhtes patsiendi haigusvaba elulemusele DFS. DFS-i võrreldi Kaplan-Meieri kõverate ja logaritmi aatri testiga kõrge punase jooni ja madala sinine joon ekspressioonigruppide vahel, mis määrati iga miRNA-spetsiifilise lävega.
Täissuuruses pilt Supresseerivate miRNAde elulemuse analüüs erinevates etappides ja alatüüpides Edasiseks selgitamiseks, milline kliiniline staadium ja histoloogia miRa ja mirc näitavad oma tuumori supresseerivat funktsiooni, teostasime nende kahe miRNA-de erinevatel TNM etappidel ja alatüüpidel ellujäämise analüüse. Teadaolevalt on rinnavähil kaks olulist alatüüpi, millel on erinevad signaalivõrgud ja ravimi sihtmärgid 63 ning erinevad prognostilised allkirjad Seetõttu teostasime PAM50 klassifikatsiooni alusel rinnavähi luminaalsete ja basaalsete alatüüpide ellujäämise analüüsi.
aasta pressiteated | Tartu Ülikool
Leiti, et miRc kõrge ekspressioon seostub oluliselt ER-positiivse rinnavähiga patsientide parema prognoosiga. MiRc kõrge ekspressiooniga patsiendid näitasid suundumust parema prognoosi tekkeks nii varases kui kaugelearenenud staadiumis rinnavähis, kuid see ei olnud statistiliselt oluline joonis 5.
Why do my Knees Hurt From Spinning®? Exercises to reduce knee pain from cycling.
MiRa OS-i analüüsid igas etapis ja alatüüpides ER-positiivsed ja kolmekordsed negatiivsed alarühmad. OS-i võrreldi Kaplan-Meieri kõverate ja logaritmi Hurt spin onkoloogia testiga kõrge punase jooni ja madala sinine joon ekspressioonigruppide vahel, mis määrati miRNAa-spetsiifiliste lävenditega. Täissuuruses pilt MiRc OS-i analüüsid igas etapis ja alatüüpides ER-positiivsed ja kolmekordsed negatiivsed alarühmad. OS-i võrreldi Kaplan-Meieri kõverate ja log-rank testiga kõrge ja madala ekspressioonirühma vahel, mis määrati miRNAc-spetsiifiliste lävenditega.
Kui Coxi regressioonianalüüsis määratleti kliinilistes etappides või hormonaalsetes alatüüpides kovariandid, ei näidanud 2 miRNA-d olulisi erinevusi täiendav tabel S1. ES, rikastamise skoor; NES, normaliseeritud rikastusskoor. Täissuuruses pilt On oluline uurida, kas miRa või miRc sihtmärgid on seotud vähi hallmarkiga seotud geenikomplektidega; apoptoos, rakutsükkel, rakusurm, raku liikuvus, DNA parandus, immuunvastus ja fosforüülimine 65, MiRc ekspressiooniga seostatakse mitmeid rakutsükli, DNA parandamise või fosforüülimisega seotud geenikomplekte.
Hurt spin onkoloogia fosforüülimisega seotud geenikomplektid on seotud miRa ekspressiooniga täiendav andmepakett S1. Kuigi tõendid ei ole piisavalt tugevad, näitab GSEA tulemus, et miRa ja miRc võivad mängida vähi bioloogias potentsiaalseid rolli vähi hallmarkiga seotud geenikomplektidega. Arutelu Viimase kümne aasta jooksul on paljudes uuringutes näidatud rinnavähi individuaalset bioloogilist mitmekesisust, nagu näiteks genoomide laiaulatuslikel analüüsidel põhinevad alatüübid 67, 68, 69 ja muud rinnavähi heterogeensuse allikad 70, 71, Nende analüüside põhjal on kasutatud kliinilise klassifikatsiooni kliinilise klassifikatsiooni hindamiseks hormoonravi või molekulaarselt suunatud ravi Hurt spin onkoloogia 68, Näiteks genereeriti luminaalsed alatüübid kodeeriva geeni ekspressiooni kaudu.
Teisest küljest Kuidas eemaldada valu ja liigese poletik ole ncRNA ekspressiooni nii ulatuslikult uuritud.
Kuigi paljud kasvajaga seotud miRNA-d, sealhulgas onkogeensed miRNA-d ja tuumori supresseerivad miRNA-d, on rinnanäärmevähi prognostiliste biomarkeritena selgitatud, on vähesed neist valideeritud suurte kohortide abil. TCGA andmekogum sisaldab põhjalikku geneetilist ja epigeneetilist informatsiooni, samuti kliinilisi andmeid, nagu vanus, sugu, rass, patoloogiline diagnoos, ellujäämine ja kasvaja kordumine üle rinnavähi patsiendi.
Praeguseks on mõned aruanded seda avalikku Hurt spin onkoloogia kasutanud kui kasvaja supresseeriva miRNA rinnavähi valideerimisgruppi.
Kõrva vähk - Fibroom April
Seetõttu teostasime esmalt süstemaatilise kirjanduse otsingu ja määrasime paljulubavad kasvaja supresseeriva miRNA kandidaadid rinnavähi prognostiliste biomarkeritena. Seejärel hindasime nende kliinilist tähtsust TCGA kohordi kasutamisel. On teatatud, et MiRa on suunatud EMT-ga seotud molekulidele nagu vimentiin või Slug ning pärsivad kasvajarakkude migratsiooni ja invasiooni rinnavähi 20, 23 ja teiste tahkete vähktõvega MiRc on vähktõve üks tuntumaid kasvaja supresseerivaid miRNA-sid.
Hurteau et al. Lisaks on paljudes aruannetes näidatud, et miRc-l on rinnavähi 46, 47, 50, 51 ja teiste tahkete vähkidega seotud EMT-ga seotud kasvaja supresseerivad funktsioonid 74, 75, 76, MiRa ja miRc kui prognostiliste biomarkerite kliinilist tähtsust ei ole kunagi uuritud suurte kohortide kasutamisel.
Kõrva vähk
Meie teadmiseks on see esimene aruanne, mis näitab kasvaja supresseerivate miRNA-de prognoosilist tähtsust rinnavähiga patsientidel, kes kasutavad piisavalt suurt kohort. Me mõistame, et meie uuringus on Hurt spin onkoloogia. TCGA andmestik koguti mitmest instituudist, mis võib meie meetoditele kaasa tuua valikuvõimalusi. Samuti puudusid andmed, nagu mõnedel patsientidel TCGA kohordi kohta puudusid kliinilised Hurt spin onkoloogia.
Peale selle, kuigi TCGA-l on rinnavähiga patsientide suur valim, on paari normaalse rinnanäärme koega patsientide arv oluliselt väiksem, mis võib olla takistanud selle analüüsi statistilist jõudu.
Meie teadmiseks on see esimene aruanne, milles selgitati, kas on võimalik kasutada avalikult kättesaadavat andmebaasi nagu TCGA, et kinnitada kasvaja supresseeriva miRNA kliinilist tähtsust rinnavähiga patsientidel. Materjalid ja meetodid Kirjanduse otsing, et tuvastada rinnanäärmevähi korral väljakujunenud kasvaja supresseerivad miRNA-d Aastatel ja viisime läbi PubMed Central'i abil kirjanduse otsingu, et tuvastada väljakujunenud kasvaja supresseerivad miRNA-d rinnavähi korral.
Valiku kriteeriumid olid: 1 vähemalt kaks uurimisrühma on näidanud, et valitud miRNA-l on ainult kasvaja supresseeriv funktsioon ja mitte onkogeenne funktsioon nii in vitro kui ka in vivo, 2 miRNA sihtmärk-mRNA või signaaliülekande rada on olnud 3 rinnanäärmevähi patsientide suure kohordi kasutamisel ei ole veel uuritud miRNA kliinilist tähtsust.
Rinnanäärmevähiga patsientide elulemuse andmed TCGA-s saadi vastavalt eelnevalt teatatud andmetele Kuna TCGA on de-identifitseeritud avalikult juurdepääsetava andmebaasi kogum, loobuti institutsioonilise läbivaatamise nõukogu läbivaatamisest.
2011. aasta pressiteated
Kasvaja supresseerivate miRNAde prognoosiline analüüs TCGA kohordi kasutamisel Üldine elulemus OS määratleti kui ajavahemik alates diagnoosimise kuupäevast surma kuupäevani mis tahes põhjusel ja haigusvaba elulemus DFS määratleti kui aeg alates diagnoosimise kuupäevast kuni korduva haiguse diagnoosimise kuupäevani. Patsiendid, kellel ei olnud sündmust, tsenseeriti viimasel jälgimispäeval või pärast 10 aastat kliinilistest andmetest.
OS-i või DFS-i võrreldi Coxi proportsionaalse ohumudeliga ekspressioonigruppide vahel kõrge versus madalmis määrati iga miRNA-spetsiifilise künnisega. Nimelt hinnati kahe rühma vahelisi OS-i erinevusi mitme kandidaadi katkestuspunkti piires vaadeldava ekspressiooni väärtuse vahemikus ja optimaalne lõikepunkt valiti Coxi proportsionaalse ohumudeli statistilise olulisuse alusel.
Samuti viidi läbi stratifitseeritud analüüsid. Mudelites sisalduvad kovariandid hõlmasid kasvaja TNM-i etappi Ameerika vähivastase kliinilise vähktõve ühiskomisjoni 7.
TCGA andmestikus määrati histoloogilised alatüübid patoloogilise molekulaarse alatüüpimise abil 78, Me teostasime GSEA Hallmarki geenikomplektide jaoks, mis kokku võtsid kokku spetsiifilised täpselt määratletud bioloogilised seisundid või protsessid ning esitasid koherentset ekspressiooni. Patsiendid dikrotiseeriti madala ekspressiooniga rühmadeks ja kõrge ekspressiooniga rühmadeks miRNA ekspressioonitasemete põhjal. Dikotoomi künnise määramiseks kasutati jooksvat Coxi proportsionaalse ohu statistikat Individuaalsete rühmade ellujäämise kõverate võrdlemiseks kasutati vajaduse korral Kaplan-Meieri meetodit koos log-rank testidega ja Coxi proportsionaalsete ohumudelitega.
Proportsionaalse ohtlikkuse eelduse testimiseks Cox mudelitel kasutati Schönfeldi jääkide testi.
Komen uurija algatatud uurimisgrant IIR, samuti institutsionaalse toetuse toetus 71—— Me hindaksime ka TCGA konsortsiumi. Elektrooniline täiendav materjal Täiendavad andmed Märkused Kommentaari esitamisega nõustute järgima meie tingimusi ja ühenduse suuniseid.
Kui leiate midagi kuritahtlikku või ei vasta meie tingimustele või juhistele, märkige see sobimatuks. Toimetaja Valik.